再生資源產業集成系統是產業集群發展的階段，它是按照產業生態學原理和循環經濟理念營造和構建的。在時空結構上按照集成思想排列的，采取循環經濟模式運行的產業集群。首先，從構成主體看，再生資源產業集成系統是由大量具有互惠共生關系的子系統按照物質循環利用、食物鏈上下游耦合連接而成的。這些子系統通常以企業群落的形式表現出來，而這些子系統又是由大量相關企業聚集而成的。再生資源產業集成是一種可持續的產業發展模式。相較于傳統的產業組織結構，再生資源產業集成將關注的焦點從集中度、產品差別化程度、進入壁壘等轉移到對生態平衡規律的重視，在追求經濟增長的同時，注重對環境的保護和資源的節約，目標是促進經濟增長、人類進步和工業發展的協調共進。

企業群落組成的子系統包括三大基本類型：生產者子系統、消費者子系統和分解者子系統。它們結合在一起構成一個類似于自然生態結構的產業共生網絡。其次，從循環經濟理念看，再生資源產業集成系統內的物質循環在多層次、多網絡、多環路上都在進行。企業內部有微循環，企業群落構成之間、子系統內部有中循環，子系統之間有大循環。物質、能量、信息的流動既在各個循環內展開，也在各個循環之間進行。從集成看，產業是由眾多的要素（單元、子系統）構成的開放系統，產業組織是建立在產業系統、生態系統之上并以其為對象的，因而具有系統性。再生資源產業集成以產業系統整體優化為目標的，一方面通過集成各類要素增加自身的新功能，另一方面通過各類要素的協同作用促進產業系統有序程度的提高。再生資源產業集成的基礎是系統論、控制論、協同論和信息論，通過多反饋環的鏈網擴張作用，一方面要建立產業系統與自然系統之間的負反饋聯系，另一方面實現了產業間和產業內基于物質流、能量流、信息流的耦聯機制。負反饋使產業系統趨于穩定，耦聯使產業系統內的元素形成類似于生物鏈的共生結構，從而形成一個具有反饋機制的產業生態結構系統，以保持產業持續成長和生態長期穩定。